V skladu s standardom IEC je treba baterijo hraniti pri temperaturi 20 stopinj ±5 stopinj in vlažnosti (65±20) odstotkov. Na splošno velja, da višja kot je temperatura shranjevanja baterije, nižja je stopnja preostale zmogljivosti in obratno, najboljše mesto za shranjevanje baterije je, ko je temperatura v hladilniku 0 stopinj -10 stopinj, zlasti za primarno baterijo. Po drugi strani, tudi če sekundarna baterija po shranjevanju izgubi svojo zmogljivost, jo je mogoče obnoviti z večkratnim ponovnim polnjenjem in praznjenjem.
Teoretično je pri shranjevanju baterije vedno izguba energije. Inherentna elektrokemijska struktura same baterije določa neizogibno izgubo kapacitete baterije, predvsem zaradi samopraznjenja. Običajno je velikost samopraznjenja povezana s topnostjo katodnega materiala v elektrolitu in njegovo nestabilnostjo (lahka samorazgradnja) po segrevanju. Samopraznjenje baterij za ponovno polnjenje je veliko večje kot pri primarnih baterijah.
Če želite baterijo shraniti za dalj časa, je najbolje, da jo hranite v suhem okolju z nizko temperaturo in naj bo preostala napolnjenost baterije približno 40 odstotkov. Seveda je najbolje, da baterijo vzamete ven in jo uporabite enkrat na mesec, s čimer lahko zagotovite ne le dobro ohranjenost baterije, ampak tudi preprečite, da bi se baterija popolnoma izpraznila in poškodovala.